魔法少女们决定对各个时空进行统一的管理，时崎狂三代表时间，星宫六喰代表空间，两人合作成立了时空管理局。

时空管理的三巨头有高町奈叶、菲特、八神疾风，负责收集各个时空的圣石种子和夜天之书的书页。