在大明之前对于这些藩属的管理中，为什么坚持厚往薄来的政策，就是因为大明君臣认为，相比于对丝绸、 宝船等物质的羡慕，稳定的社会秩序和稳固的统治对小国统治者们显然更具有吸引力，只要大明能够在这方面做好，使得这些藩属们接受大明礼制的教化，就可以使得他们心悦诚服。

阁臣们认为，只要大明做好自己，使得礼制规范在各朝贡国得到扩散和内化，那么自然就会对这些国家的行为产生影响，一方面制约他们的行为不“违礼”，另一方面引导他们的行为以更加“合礼”。使得这些藩属国认同大明，从而保土安民，上奉天道，尊事中国。

朱载坖认为，这种办法也许在之前是行得通的，但是现在时代变化了啊，这些西夷哪讲什么礼仪？人家凭借的就是坚船利炮，哪里跟你讲什么礼仪道德，就是干就完了，大明在南洋的藩属国已经不剩下几个了，再搞下去，大明的羽翼被剪除了之后，他们就要对大明下手了，所以朱载坖认为，必须要设立专门的机构，管理这些藩属，同时对于这些藩属，也不能再放任自流了。

首先要对付的就是朝鲜，朱载坖在和阁臣们的商量之后，决定对于朝鲜要狠狠的敲打了，朱载坖再度给朝鲜下达诏书，在诏书中，朱载坖要朝鲜回忆当年李成桂向大明承诺的慎封疆之守，事大以礼、事大以诚的诺言，并且要求朝鲜立即和倭国断绝一切联系，否则后果自负。

同时朱载坖正式要求内阁和吏部、礼部、兵部等衙门商量，首先将大明各个衙门中有关藩属事务的机构，将他们的执掌列明，为组建一个专管藩属的衙门做准备。

经过吏部的汇总，和朝贡藩属有关的衙门除了礼部主客司之外，还有部仪制司、鸿胪寺、兵部、四夷馆、户部、光禄寺等衙门，礼部仪制司掌诸礼文、宗封、贡举、学校之事，有关这些藩属进奏的文书等，格式是否正确，是需要仪制司来先行审核的。

而鸿胪寺掌朝仪、宾客等相关事宜，在这些藩属的朝贡过程中也要起到很重要的作用，外夷朝贡、接受赏赐时皆到鸿胪寺演练朝见礼仪。再者，外夷朝贡、受赏皆由鸿胪寺引见，如外夷进贡方物时，鸿胪寺官将其引至御前，胪寺主要负责朝贡礼仪和转呈保单、奏本之事。

兵部涉及的主要是会同馆隶属问题与夷情处置两个方面，会同馆原本是兵部车驾司管辖的，是接待外国和边疆民族贡使的场所，同时是大明与朝贡使团进行经济贸易活动的场所，还是大明与朝贡者开展外交活动的主要场所。现在已经移交给主客司管理了，还有就是一旦有夷情发生，兵部作为总管军务的部门，是要对此事发表建议的，尤其是在涉及到用兵的问题上。